根據印尼中央統計局(CBS)資料,2002年至2007年10月間的台印尼雙邊貿易於2004年達到高峰,總金額為40億9459萬美元,同年印尼出口到台灣金額亦達28億5425萬美元的高峰,2005年印尼從台灣進口金額達高峰13億3807萬美元。2007年1至10月的台印尼雙邊貿易金額為34億3089萬美元,印尼出口到台灣達22億2607萬美元,印尼從台灣進口達12億482萬美元,印尼享有順差10億2124萬美元,主因台灣從印尼進口大量的天然氣、煤炭及大宗物資等。
台灣有2,300萬人口,首都為台北市,是一個高所得的國家,平均國民所得為14,770美元。台灣有農業(家禽、稻米、糖、茶葉、玉米、水果及蔬菜)及礦物(煤、銅、硫磺、大理石、水泥及石油)的天然資源,並積極發展電子業。
台灣與印尼已簽有下列重要的協定:能源合作協議、海洋漁業及農業協定、避免雙重課稅協定以及投資保障協定。
在雙向投資方面,據印尼投資協調委員會(BKPM)統計顯示,1997年1月至2007年底台灣共有1210投資案件,投資總金額為150億美元,名列前茅,創造數十萬工作機會,目前約有7千多位台灣技術人員住在印尼。
在印尼投資的幾家大公司有寶成鞋業、宏碁電腦、中國信託銀行、統一食品、榮工處及南亞塑膠。每週由中華航空公司及長榮航空公司經營的從台北飛往印尼有51個班機,其中包括從台北飛往雅加達的航線有20個班機、往峇里島有28個班機及泗水有3個班機。每年到印尼觀光約有30萬人,其中到峇里島及其他景點的台灣觀光客約有25萬人。台灣在印尼派駐農技團已超過30年歷史,協助印尼重點地區發展農漁產業,甚獲好評。